生物資訊實驗室 | 非營利組織網
研究人員.蔡懷寬Huai-KuangTsai(召集人);宋定懿Ting-YiSung;何建明 ...
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研究人員 博士後研究學者 研究群介紹 本實驗室的研究是以資訊技術應用在生物和醫學研究為主,針對不同生物體學(omics)上的生物學和生物醫學進行解析,主要研究可分成基因體和轉譯體研究,蛋白體及代謝體研究兩大部份,分別詳述如下。(1) 基因體和轉譯體研究
處理巨量定序資料的方法論開發: 新世代定序技術已成為基因體和轉錄體研究的主要工具。然而定序的資料量相當龐大,定序的序列也常有錯誤,因此在資料處理時,常造成記憶體不足和計算時間冗長等困擾,亟待解決。因此,近年來我們致力於發展新的方法和開發新的工具來解決一連串計算的問題。在次世代 read mapping 上,我們發展了一個極為快速的演算法 Kart。Kart 將一個 read 分解成更小的碎片,並將其個別匹配到基因序列。實驗結果證實 Kart 比一般 mappers 快三到十倍之多,而且錯誤容忍度及準確度均極高。同樣的方法也可以應用在 RNA-seq 上,效果也甚佳。在基因體組裝方面,我們設計一套以延伸為基礎的組裝程式(稱為 JR-Assembler)利用整個短序做延伸,加快執行速度。另外利用跨過小於序列長度的重複片段等方式來大幅降低記憶體的需求和執行時間,同時也考慮組裝的品質。和其他程式比較,JR-Assembler 的記憶體使用率和執行時間更有效率,而且保持良好的組裝品質,特別對於序長度等於及大於 150 bp 的基因組資料。
處理巨量定序資料的工具和資訊整合平台開發: 我們發展 Mapreduce ...
2020中研院資訊科學研究所暑期實習生研究計畫 | 非營利組織網
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財團法人亞太和平研究基金會統編是多少?統一編號:17154339
組織名稱:財團法人亞太和平研究基金會統一編號:17154339所在縣市:臺北市異動日期:1060414異動原因:變更負責人(含IDN)
中央研究院資訊科技創新研究中心統編是多少?統一編號:48928345
組織名稱:中央研究院資訊科技創新研究中心統一編號:48928345所在縣市:臺北市異動日期:1050727異動原因:變更負責人(含IDN)
中央道院統編是多少?統一編號:17715825
組織名稱:中央道院統一編號:17715825所在縣市:彰化縣異動日期:980106異動原因:一般註銷
財團法人亞太安全研究基金會統編是多少?統一編號:18480115
組織名稱:財團法人亞太安全研究基金會統一編號:18480115所在縣市:臺北市異動日期:891212異動原因:申請設立登記
中央研究院資訊科學研究所統編是多少?統一編號:4142327
組織名稱:中央研究院資訊科學研究所統一編號:4142327所在縣市:臺北市異動日期:1070910異動原因:變更負責人(含IDN)
台灣工業與應用數學會統編是多少?統一編號:37821970
組織名稱:台灣工業與應用數學會統一編號:37821970所在縣市:新竹市異動日期:1070712異動原因:變更負責人(含IDN)
思與言人文社會學社統編是多少?統一編號:76339869
組織名稱:思與言人文社會學社統一編號:76339869所在縣市:臺北市異動日期:1090220異動原因:變更負責人(含IDN)
中華創新資訊與應用統計學會統編是多少?統一編號:38611760
組織名稱:中華創新資訊與應用統計學會統一編號:38611760所在縣市:臺北市異動日期:1030919異動原因:申請設立登記
財團法人亞太安全研究基金會統編是多少?統一編號:18480115
組織名稱:財團法人亞太安全研究基金會統一編號:18480115所在縣市:臺北市異動日期:891212異動原因:申請設立登記
中華機率統計學會統編是多少?統一編號:78535058
組織名稱:中華機率統計學會統一編號:78535058所在縣市:臺中市異動日期:1080305異動原因:變更負責人(含IDN)
中華應用統計學會統編是多少?統一編號:29220762
組織名稱:中華應用統計學會統一編號:29220762所在縣市:新北市異動日期:1040318異動原因:變更負責人(含IDN)
財團法人亞太和平研究基金會統編是多少?統一編號:17154339
組織名稱:財團法人亞太和平研究基金會統一編號:17154339所在縣市:臺北市異動日期:1060414異動原因:變更負責人(含IDN)
中央道院統編是多少?統一編號:17715825
組織名稱:中央道院統一編號:17715825所在縣市:彰化縣異動日期:980106異動原因:一般註銷
中央研究院資訊科學研究所統編是多少?統一編號:4142327
組織名稱:中央研究院資訊科學研究所統一編號:4142327所在縣市:臺北市異動日期:1070910異動原因:變更負責人(含IDN)
臺灣醫療人類學學會統編是多少?統一編號:76874377
組織名稱:臺灣醫療人類學學會統一編號:76874377所在縣市:臺北市異動日期:1081217異動原因:申請設立登記