Python SimpleITK 影像處理教學:讀取DICOM 影像序列檔案 | 非營利組織網
介紹如何使用Python的SimpleITK模組讀取DICOM影像序列檔案,查看後設資料(metadata)、轉存為其他格式的三維影像檔案。這裡我們使用DICOMLibrary所提供的CT ...
介紹如何使用 Python 的 SimpleITK 模組讀取 DICOM 影像序列檔案,查看後設資料(metadata)、轉存為其他格式的三維影像檔案。
這裡我們使用 DICOM Library 所提供的 CT 影像[1]作為示範,除此之外 ORS 的網站[2]上面也有提供許多可用來測試的影像檔案。首先載入 SimpleITK 模組,並建立 ImageSeriesReader 影像序列讀取器:
import SimpleITK as sitk # DICOM 影像序列檔案所在目錄 dicom_folder = "/mnt/data/ct_image" # 建立影像序列 Reader reader = sitk.ImageSeriesReader()在一個目錄之中有可能存在多組 DICOM 影像的 Series,我們可以先以 GetGDCMSeriesIDs 取得所有 DICOM 影像的 Series IDs:
# 取得所有 DICOM 影像的 Series IDs series_ids = reader.GetGDCMSeriesIDs(dicom_folder) print(*series_ids, sep = " ") 1.2.826.0.1.3680043.8.1055.1.20111102150758591.96842950.07877442接著根據 Series ID 取得 DICOM 影像序列的所有檔案名稱(如果該目錄只有一組 DICOM 影像 Series,呼叫 GetGDCMSeriesFileNames 時亦可省路 Series ID):
# 取得指定 Series ID 的 DICOM 影像序列檔案名稱 series_id = "1.2.826.0.1.3680043.8.1055.1.20111102150758591.96842950.07877442" dicom_filenames = reader.GetGDCMSeriesFileNames(dicom_folder, series_id) print(*dicom_filenames...Photoshop 中的DICOM 檔案 | 非營利組織網
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